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基于10XNextGEM技術(shù),，單細(xì)胞測序一次實(shí)驗(yàn)可以同時檢測近萬個細(xì)胞，可在一個樣本中同時獲3端mRNA表達(dá)譜,、如需和免疫組庫（TCR和BCR）的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時,，即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析，監(jiān)測免疫療法的效果,，研究疾病發(fā)生,、發(fā)展的分子機(jī)制，可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測序：烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備：1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),，一次實(shí)驗(yàn)可同時獲取1000-20000個細(xì)胞的文庫構(gòu)建,，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)；具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程,，獲取V(D)J全長序列的配對信息,；豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，實(shí)現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),，搭配單細(xì)胞分析云...

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,，需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,，這對SingleCell分選標(biāo)記、建庫,、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,，將會影響建庫的成功率；計(jì)數(shù)偏低,，則會提高雙細(xì)胞的比例,；而細(xì)胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有PrimeTreat,、CellLoad,、BeadLoad、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式，來對應(yīng)...

10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),，也是目前國內(nèi)和國際上公認(rèn)的單細(xì)胞測序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺技術(shù),，該平臺基于動態(tài)微流控原理，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,，組織解離后,，單個樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個細(xì)胞， 基于每個細(xì)胞分別建庫測序,，獲得單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),，并鑒定細(xì)胞的類型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時間和降低測序成本,。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測序平臺。蘇州10X Chromium...

單細(xì)胞多組學(xué)提升見解基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo),。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,，為您帶來樣本的真實(shí)視圖,。烈冰2021年強(qiáng)勢引進(jìn)的10xGenomicsChromium單細(xì)胞平臺能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實(shí)驗(yàn),，也節(jié)省了您需要分析的樣本,，而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過計(jì)算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系,。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,，一次對...

所謂的高通量測序技術(shù),，又名大規(guī)模平行測序,，是將DNA（或者cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭,，制備測序文庫,，通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測對應(yīng)的信號,，獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法（Sanger法等）相比,，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克隆）,，成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù),。單細(xì)胞測序是一個系統(tǒng)的工程，開展項(xiàng)目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,，如果匹配,，實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺如何選擇,，樣本如何制備,，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前,，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,，從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對接渠道,，幫助...

烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,，經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞,。針對不同的分選平臺,、建庫方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程,；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求,。高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺,，包括NovaSeq6000、10XChromiumX,、BDFACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校,、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航?；?..

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時,，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,，需要進(jìn)行Downsample處理,，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程,！單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析,，認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)...

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時間特異性和空間特異性,。時間特異性可以通過收集不同時間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析,。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,，其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,，在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性,。十二年測序經(jīng)驗(yàn),，累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。蘇州10X Chromium X單細(xì)胞測序技術(shù)支持烈冰與國內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究...

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,，針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精,、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表,；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型,；一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動...

烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,，經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn)，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),，實(shí)測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞,。針對不同的分選平臺,、建庫方法,，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究,、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺,，包括NovaSeq6000,、10XChromiumX、BDFACSMelody,、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航,。個...

單細(xì)胞獲得困難,，不同組織要求不盡相同難以搞定,？烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn)，100+組織類型解離protocol,，精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,，確保單細(xì)胞的獲得,。凍存樣本無法實(shí)驗(yàn)，珍貴樣本無法使用,？烈冰采用國際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),，確保凍存組織使用。珍貴樣本,，細(xì)胞數(shù)量太少,，消化背景雜無法做單細(xì)胞？采用國際認(rèn)可的10XGenomics,，BDRhapsody雙平臺模式,，根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少，背景雜也能做單細(xì)胞,。單細(xì)胞RNA分類精度不足,，部分細(xì)胞無法細(xì)分？烈冰同時采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),，真正做到從上游到下游的全...

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,，加速科研進(jìn)程！此外,，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser）,，不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,，詳情請咨詢烈冰生物。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,，開啟更大通量測序新紀(jì)元,。烈冰科技單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析對于單細(xì)胞測序而言，常常需...

單細(xì)胞多組學(xué)提升見解基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo),。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,，為您帶來樣本的真實(shí)視圖,。烈冰2021年強(qiáng)勢引進(jìn)的10xGenomicsChromium單細(xì)胞平臺能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,，單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實(shí)驗(yàn),，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果,。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過計(jì)算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系,。烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒?yàn)...

為什么需要單細(xì)胞分辨率,？生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,，有許多獨(dú)特的單體,，也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程,。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,，才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性,。單細(xì)胞測序能夠在以一個細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,，闡明具體細(xì)節(jié),，構(gòu)建出一幅更大,、更精細(xì)的圖譜,，說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復(fù)發(fā),？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題,。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,，5000+項(xiàng)目檢驗(yàn),，真實(shí)可信賴,。武漢10X Genomics單細(xì)胞測...

基于10XNextGEM技術(shù),，單細(xì)胞測序一次實(shí)驗(yàn)可以同時檢測近萬個細(xì)胞,，可在一個樣本中同時獲3端mRNA表達(dá)譜、如需和免疫組庫（TCR和BCR）的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時,，即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,，監(jiān)測免疫療法的效果，研究疾病發(fā)生,、發(fā)展的分子機(jī)制,，可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測序：烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備：1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，一次實(shí)驗(yàn)可同時獲取1000-20000個細(xì)胞的文庫構(gòu)建,，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù),；具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程，獲取V(D)J全長序列的配對信息,；豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),，實(shí)現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務(wù)，搭配單細(xì)胞分析云...

現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別,。一個是分隔單個細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺,。在這個空間，單個細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識別?，F(xiàn)有技術(shù)的另一個主要區(qū)別是如何添加索引,，就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣。10XGenomics單細(xì)胞測序平臺采用動態(tài)微流控技（Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理）,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,，其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,，并通過微流控技術(shù),，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中,。這時候,，就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細(xì)胞以及一個凝膠微珠,，...

單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,，不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,，存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要,。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,，即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例,。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。溫州單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,，在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后...

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,，針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精,、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot,；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型,；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap,、Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動...

針對樣本活性的問題,，10×Genomics官方建議當(dāng)單細(xì)胞懸液活性低于70%時應(yīng)做去除死細(xì)胞操作，但也需要注意到,，去除死細(xì)胞的操作會損失一定的細(xì)胞數(shù)量,，10×Genomics和MiltenyiBiotec都沒有給出單細(xì)胞懸液含有多少細(xì)胞數(shù)量才建議做去除死細(xì)胞的操作?；诹冶嗄陠渭?xì)胞測序?qū)嶒?yàn)經(jīng)驗(yàn),，建議當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測后，考慮對細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作,。而太低活性的懸液（小于30%）,，懸液中細(xì)胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),，失真嚴(yán)重,，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn)，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,。單細(xì)胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,，為從...

單細(xì)胞獲得困難,，不同組織要求不盡相同難以搞定？烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),，100+組織類型解離protocol，精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離,、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,，確保單細(xì)胞的獲得,。凍存樣本無法實(shí)驗(yàn),，珍貴樣本無法使用？烈冰采用國際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),，確保凍存組織使用。珍貴樣本,，細(xì)胞數(shù)量太少,，消化背景雜無法做單細(xì)胞,？采用國際認(rèn)可的10XGenomics,，BDRhapsody雙平臺模式，根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少,，背景雜也能做單細(xì)胞,。單細(xì)胞RNA分類精度不足，部分細(xì)胞無法細(xì)分,？烈冰同時采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),，真正做到從上游到下游的全...

單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,，可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài),，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價值,。然而,，單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序,，可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入,，無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼,，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界,。吉林10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),，也是目前國內(nèi)和國...

烈冰生物搭建近10臺10XGemomics平臺，目前為全國范圍內(nèi)的高校,、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供鼓舞,，10X微流體“雙十字”交叉系統(tǒng)為8或16通道系統(tǒng)，每個通道上限可捕獲20000細(xì)胞,，16通道一次可檢測細(xì)胞范圍為百萬級別的細(xì)胞水平,。此外，單個細(xì)胞捕獲效率高達(dá)65%,，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型,，利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究；細(xì)胞可適性高,，對細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類型無限制。細(xì)胞捕獲周期較短,，能夠?qū)崿F(xiàn)自動分離,，無需人工操作，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準(zhǔn)備工作,?；驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用，是下一個改變世界的...

關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備,，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,，也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要,，您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型,。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度,、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無論具體的考慮因素如何,，所有樣本類型都遵循同一個基本原則，那就是生...

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破,，基于“邊合成邊測序”（sequencingbysynthesis）和大規(guī)模平行測序技術(shù)（massiveparallelanalysis,MPS）,，使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如IlluminaSolexa測序儀,。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構(gòu)建,、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析,。由于讀長限制,，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3和5端接上3種序列：1）Index,，用于區(qū)分樣品來源,；2）Adapter，用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn),；3）Primerbindingsite,，用于結(jié)合PCR引物...

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動,，因此細(xì)胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制,，微流體通道的直徑約為50~60um，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過40um,。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時,，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗,，對于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時候，往往會遇到一個尷尬的問題,，就是目標(biāo)細(xì)胞,，例如神經(jīng)元細(xì)胞、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大,，不適用于10X單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大，直接超過了芯片中管道的直徑,，雖然心肌細(xì)胞直徑低于50um,，但是成熟心肌細(xì)胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗,，這也是為什么現(xiàn)...

相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,，10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量，這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型,。因此,，這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,，都會更實(shí)用,。同時依托RandomCellLabel技術(shù)，使得其對于NovaSeq,、HiSeqXTen,、Hiseq4000等設(shè)備存在的Indexhooping現(xiàn)象，相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,，影響幾乎可以忽略不計(jì)（10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,，顯示無影響。單細(xì)胞測...

相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,，10X平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細(xì)胞量,，這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型。因此,，這兩種技術(shù)對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,，無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說，都會更實(shí)用,。同時依托RandomCellLabel技術(shù),，使得其對于NovaSeq、HiSeqXTen,、Hiseq4000等設(shè)備存在的Indexhooping現(xiàn)象,，相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說，影響幾乎可以忽略不計(jì)（10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,，顯示無影響,。截至20...

單細(xì)胞RNA-seq,、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個共同過程，即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析,。不過,，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,，然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫，從而測定整個轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá),。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),，并通過熒光測定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),，而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而，這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況,。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或...

烈冰與國內(nèi)高校,、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),，1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計(jì)）,，在單細(xì)胞領(lǐng)域,，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇，總IF＞300+,，IF＞10+以上文章占比65%以上,，包含Immunity、NatureCellBiology,、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究,、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,，免疫研究、腦神經(jīng),、白血病,、胚胎發(fā)育、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。單細(xì)胞測序平臺，烈冰提供高性價比服...

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,，在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟。在理想狀況下,，一旦制備好樣本,，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,，您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì)，因?yàn)檫@可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間,，以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時間,，它們就開始形成團(tuán)塊,。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險,，而且每個團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,，有些細(xì)胞更加粘稠,，形成團(tuán)塊的速度更快。對于這些細(xì)胞,，必須盡量減少制備和使用之間的時間差烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文...