CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質-DNA相互作用的技術,,它們有一些關鍵的區(qū)別:1.**技術原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技術利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結合來進行DNA切割,。ChIC的優(yōu)勢在于使用TF特異性抗體系住MNase,并只在結合位點裂解,。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技術則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復合物,,留下寡核小體。CUT&RUN通過在冰上進行簡短的消化反應,在TF結合的MNase擴散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質之前在上清中恢復TF-DNA復合物,。2.**操作步驟和簡便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,這可能重新引入了ChIP-seq的一些問題,,如交聯(lián)導致的DNA和蛋白質的化學修飾,。-**CUT&RUN**:CUT&RUN簡化了操作步驟,使用磁珠固定細胞核,,適用于新鮮和冷凍組織樣本,,縮短了生成DNA測序文庫的時間(1-2天)。3.**背景信號和信噪比**:-**ChIC**:ChIC產生的背景信號可能較高,,因為它可能涉及到非特異性的DNA切割,。
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學實驗中都是常用的酶,,但它們之間存在一些關鍵的不同點:1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,,能夠承受PCR的熱變性步驟,。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,,適用于等溫擴增,,如LAMP技術,無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,,但沒有3'-5'外切酶活性,。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低,。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強鏈置換活性,,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫擴增中更為有效,,尤其是在需要高保真度和快速擴增的應用中,。3.**應用領域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術,適用于各種DNA片段的擴增,,包括復雜模板和長片段的擴增,。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫擴增技術,如LAMP,,這些技術不需要溫度循環(huán),,適用于快速、低成本的DNA擴增,。4.**擴增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫擴增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴增速度和更高的產量,,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應中。
耐高鹽全能核酸酶(SaltActiveUltraNuclease)是一種重組非特異性核酸內切酶,具有以下特點和應用:1.**來源與表達**:耐高鹽全能核酸酶來源于海洋微生物,,通過基因工程改造在大腸桿菌(_Escherichiacoli_)中表達純化,。2.**活性條件**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效,。3.**應用領域**:-**病毒純化,、疫苗生產**:作為宿主殘留核酸去除試劑,將宿主殘留核酸降至皮克(pg)級別,,提高生物制品功效和安全性,。-**蛋白和多糖類制藥工業(yè)**:用于去除核酸污染,降低細胞上清和細胞裂解液的粘度,,提高蛋白純化效率及功能研究,。-**防止細胞結團**:有效防止細胞和疫苗研究中外周血單核細胞(PBMC)的結團。4.**產品性質**:-分子量:24.7kDa,。-等電點:9.61,。-純度:≥99%。-酶活:250-300U/μL,。-適溫度:37℃(工作范圍0-42℃),。-輔助因子:1-10mMMg2+,。5.**儲存條件**:以無菌液體酶的形式提供,儲存于緩沖液(25mMTris-HCl,,5mMMgCl2,,500mMNaCl,50%Glycerol,,pH7.5)中,,無色透明液體。干冰運輸,,-15℃~-25℃保存,,有效期2年。
在PCR實驗中,,除了BsuDNAPolymerase,,還有幾種聚合酶適合高溫擴增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,,來源于Thermusaquaticus,,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,,可以承受PCR的熱變性步驟,,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來源于Pyrococcusfuriosus,,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,,提供校正功能,,適用于對PCR保真性要求較高的實驗,,如基因篩選、克隆表達,、突變檢測,、定點突變等。3.**VentDNAPolymerase**:來源于Litoralis棲熱球菌,,具有3'→5'外切酶活性,,可以去除錯配的堿基,具有校對功能,,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍,。4.**KODDNAPolymerase**:來自Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,,保真性比PfuDNAPolymerase更高,,優(yōu)化后的PCR反應緩沖液能使得其擴增速度達到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍,。5.**BstDNAPolymerase**:來源于Bacillusstearothermophilus,,具有3'到5'外切割活性,適用于等溫擴增反應,如LAMP技術,,可在恒溫下進行DNA擴增,,無需繁瑣的溫度循環(huán)。E2酶接收來自E1的激起泛素,,并在E3酶的協(xié)助下將泛素分子轉移到靶蛋白上,。
在PCR產物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的應用和優(yōu)勢,,但它不能完全替代其他酶,。以下是一些替代酶和它們的特點:1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈DNA的平末端,、5'-突出末端或切口,,從DNA鏈的3'-端釋放5'-單磷酸核苷酸,產生單鏈DNA片段,。-與Lambda核酸外切酶相比,,ExoIII對具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶則對5'-磷酸化的雙鏈DNA有更高的活性,。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP進行“3'dA加尾”,以提高連接效率,。-這種方法通過在PCR產物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),,增加了與載體連接的可能性,從而提高克隆效率,。3.**TOPO克隆載體**:-TOPO克隆載體含有共價連接的DNA拓撲異構酶I,,可同時作為限制性內切酶和連接酶。-與傳統(tǒng)PCR克隆載體相比,,TOPO克隆載體具有更短的連接反應時間,、更高的克隆效率以及更簡單的分子克隆實驗方案。綜上所述,,雖然Lambda核酸外切酶在特定情況下非常有用,,但它不能完全替代其他酶。每種酶都有其獨特的特性和應用場景,,選擇合適的酶取決于具體的克隆需求和實驗設計,。UBE2L3作為泛素化途徑中的關鍵酶,其在蛋白質降解,、信號傳導,、細胞周期控制等重要內容有著作用。Recombinant Human PRL-2/PTP4A2 Protein,His Tag
Pfu DNA Polymerase在定點突變中的應用:Pfu DNA Polymerase是定點突變實驗的酶,,因其高保真性和穩(wěn)定性,。Recombinant Human CD155/PVR(hFc Tag)
使用BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads(血液基因組DNA提取試劑盒,,磁珠法)進行血液樣本中基因組DNA的提取,主要步驟如下:1.**實驗準備**:準備抗凝全血樣本(如EDTA抗凝血),,移液器及無菌,,15ml離心管,無水乙醇,,70%乙醇,,干凈的吸水紙,渦旋振蕩器,,金屬浴/水浴,,臺式離心機等。2.**樣本處理**:取適量血液樣本,,根據試劑盒要求,,可能需要將血液體積調整至特定量,例如200μl,,并可能需要加入PBS緩沖液,。3.**裂解血液細胞**:向血液樣本中加入蛋白酶K和細胞裂解液,渦旋混勻后,,置于金屬浴或水浴中進行裂解,,通常在65°C孵育10-15分鐘,并在此期間定期混勻,。4.**DNA與磁珠結合**:向裂解后的樣本中加入異丙醇和磁珠懸浮液,,渦旋混勻后,室溫放置一段時間,,以便于基因組DNA與磁珠結合,。5.**磁珠分離**:將樣本置于磁力架上,待磁珠聚集后,,小心移除上清液,,去除雜質,。6.**洗滌磁珠**:向磁珠中加入漂洗液和洗滌液,,進行洗滌以去除殘留的蛋白質和鹽分,然后再次使用磁力架分離磁珠,,移除洗滌液,。